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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Soja; Embrapa Suínos e Aves. |
Data corrente: |
20/11/2014 |
Data da última atualização: |
07/04/2022 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
SOUZA, R. C.; HUNGRIA, M.; CANTAO, M. E.; VASCONCELOS, A. T. R.; NOGUEIRA, M. A.; VICENTE, V. A. |
Afiliação: |
RENATA CAROLINI SOUZA, UFPR; MARIANGELA HUNGRIA DA CUNHA, CNPSO; MAURICIO EGIDIO CANTAO, CNPSA; ANA TEREZA RIBEIRO VASCONCELOS, Laboratório Nacional de Computação Científica; MARCO ANTONIO NOGUEIRA, CNPSO; VÂNIA APARECIDA VICENTE, Laboratório Nacional de Computação Científica. |
Título: |
Metagenomic analysis reveals microbial functional redundancies and specificities in a soil under different tillage and crop-management regimes. |
Ano de publicação: |
2014 |
Fonte/Imprenta: |
Applied Soil Ecology, v. 86, p. 106-112, 2014. |
DOI: |
10.1016/j.apsoil.2014.10.010 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Information about microbial functionality in agricultural soils is still scarce, and in this study we used a shotgun metagenomic approach to compare different soil [conventional tillage (CT) with plowing and disking, and no-tillage (NT) with direct sowing into the residues of previous crops], and crop [crop succession (CS, soybean-summer/wheat-winter) or rotation (CR, soybean/maize-summer)/wheat/lupine/oat-winter)] managements in a 13-year-old field experiment in southern Brazil. Differences were detected between NT and CT in some functional subsystems, e.g., NT had more sequences associated with the metabolism of aromatic compounds, which might be related to higher capacity to degrade pesticides, more sequences of the adenylate cyclase (cAMP) pathway, which might confer stability to the microbial community, among others. On the other hand, CT showed more sequences related to carbohydrate metabolism, what could be related with a lower content of organic matter and need to metabolize a broader range of carbon sources. Also, we detected differences related to crop management, e.g., crop rotation showed more sequences in the metabolism of amino acids and derivatives and carbohydrate subsystems, what might result from higher diversity of crop-residues added to the soil. However, it was notable that the differences in the diversity of taxa previously shown in the same experiment was far greater than the functional diversity reported now, emphasizing a high level of microbial functional redundancy. MenosInformation about microbial functionality in agricultural soils is still scarce, and in this study we used a shotgun metagenomic approach to compare different soil [conventional tillage (CT) with plowing and disking, and no-tillage (NT) with direct sowing into the residues of previous crops], and crop [crop succession (CS, soybean-summer/wheat-winter) or rotation (CR, soybean/maize-summer)/wheat/lupine/oat-winter)] managements in a 13-year-old field experiment in southern Brazil. Differences were detected between NT and CT in some functional subsystems, e.g., NT had more sequences associated with the metabolism of aromatic compounds, which might be related to higher capacity to degrade pesticides, more sequences of the adenylate cyclase (cAMP) pathway, which might confer stability to the microbial community, among others. On the other hand, CT showed more sequences related to carbohydrate metabolism, what could be related with a lower content of organic matter and need to metabolize a broader range of carbon sources. Also, we detected differences related to crop management, e.g., crop rotation showed more sequences in the metabolism of amino acids and derivatives and carbohydrate subsystems, what might result from higher diversity of crop-residues added to the soil. However, it was notable that the differences in the diversity of taxa previously shown in the same experiment was far greater than the functional diversity reported now, emphasizing a high level of microbial func... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Análise metagenômica. |
Thesagro: |
Análise do solo; Biodiversidade; Manejo do solo; Microbiologia do solo; Plantio direto. |
Thesaurus Nal: |
Biodiversity; Crop management; Metagenomics; No-tillage; Soil biology; Soil management; Soil microorganisms. |
Categoria do assunto: |
-- X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
Marc: |
LEADER 02578naa a2200349 a 4500 001 2000690 005 2022-04-07 008 2014 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $a10.1016/j.apsoil.2014.10.010$2DOI 100 1 $aSOUZA, R. C. 245 $aMetagenomic analysis reveals microbial functional redundancies and specificities in a soil under different tillage and crop-management regimes.$h[electronic resource] 260 $c2014 520 $aInformation about microbial functionality in agricultural soils is still scarce, and in this study we used a shotgun metagenomic approach to compare different soil [conventional tillage (CT) with plowing and disking, and no-tillage (NT) with direct sowing into the residues of previous crops], and crop [crop succession (CS, soybean-summer/wheat-winter) or rotation (CR, soybean/maize-summer)/wheat/lupine/oat-winter)] managements in a 13-year-old field experiment in southern Brazil. Differences were detected between NT and CT in some functional subsystems, e.g., NT had more sequences associated with the metabolism of aromatic compounds, which might be related to higher capacity to degrade pesticides, more sequences of the adenylate cyclase (cAMP) pathway, which might confer stability to the microbial community, among others. On the other hand, CT showed more sequences related to carbohydrate metabolism, what could be related with a lower content of organic matter and need to metabolize a broader range of carbon sources. Also, we detected differences related to crop management, e.g., crop rotation showed more sequences in the metabolism of amino acids and derivatives and carbohydrate subsystems, what might result from higher diversity of crop-residues added to the soil. However, it was notable that the differences in the diversity of taxa previously shown in the same experiment was far greater than the functional diversity reported now, emphasizing a high level of microbial functional redundancy. 650 $aBiodiversity 650 $aCrop management 650 $aMetagenomics 650 $aNo-tillage 650 $aSoil biology 650 $aSoil management 650 $aSoil microorganisms 650 $aAnálise do solo 650 $aBiodiversidade 650 $aManejo do solo 650 $aMicrobiologia do solo 650 $aPlantio direto 653 $aAnálise metagenômica 700 1 $aHUNGRIA, M. 700 1 $aCANTAO, M. E. 700 1 $aVASCONCELOS, A. T. R. 700 1 $aNOGUEIRA, M. A. 700 1 $aVICENTE, V. A. 773 $tApplied Soil Ecology$gv. 86, p. 106-112, 2014.
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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Registros recuperados : 44 | |
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Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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7. | | SOUZA, R. C. de; CANTÃO, M. E.; NOGUEIRA, M. A.; VASCONCELOS, A. T. R.; NICOLAS, M. F.; HUNGRIA, M. Biodiversidade de procariotos em solo sob plantio direto e plantio convencional em rotação ou sucessão de culturas. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBILOGIA, 26.; SIMPÓSIO INTERNACIONAL DE BACTÉRIAS LÁTICAS; ENCONTRO NACIONAL DE PROFESSORES DE MICROBIOLOGIA; SIMPÓSIO DE COLEÇÕES DE CULTURAS, 4., 2011, Foz do Iguaçu. Anais... São Paulo: SBM, 2011. Resumo, 365-1.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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8. | | SIQUEIRA, A. F.; NAKATANI, A. S.; VASCONCELOS, A. T. R. de; ALMEIDA, L. G. P. de; HUNGRIA, M. Anotação Genômica de Bradyrhizobium japonicum estirpes CPAC 15 e CPAC 7: Resultados parciais e sua importância para a cultura de soja. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 30.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 14.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 12.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 9.; SIMPÓSIO SOBRE SELÊNIO NO BRASIL, 1., 2012, Maceió. A responsabilidade socioambiental da pesquisa agrícola: anais. Viçosa: SBCS, 2012. 3 p. Trab. 1190. 1 CD-ROM. Fertbio.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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10. | | CARVALHO, F. M.; GOMES, D. F.; ORTIZ, M.; ALMEIDA, L. G.; SOUSA, R. C.; VASCONCELOS, A. T. R.; HUNGRIA, M. Genomic panorama, focused on the symbiotic context, of bradyrhizobium elkanii strains semia 587, semia 5019 and usda 76t (t é sobrescrito). In: REUNIÃO LATINOAMERICANA DE RIZOBIOLOGIA - RELAR, 27., 2016, Londrina. Fortalecendo as parcerias Sul-Sul: anais. Curitiba: SBCS-NEPAR, 2016. p. 178. Editores: Mariangela Hungria, Douglas Fabiano Gomes, Arnaldo Colozzi Filho.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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12. | | HUNGRIA, M.; NICOLAS, M. F.; GUIMARAES, C. T.; JARDIM, S. N.; GOMES, E. A.; VASCONCELOS, A. T. R. de. Tolerance to stress and environmental adaptability of Chromobacterium violaceum. Genetics and Molecular Research, Ribeirão Preto, v. 3, n. 1, p. 102-116, 2004.Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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13. | | MEDEIROS, J. D.; CANTAO, M. E.; CESAR, D. E.; NICOLÁS, M. F.; DINIZ, C. G.; SILVA, V. L.; VASCONCELOS, A. T. R. de; COELHO, C. M. Comparative metagenome of a stream impacted by the urbanization phenomenon. Brazilian Journal of Microbiology, São Paulo, SP, v. 47, n. 4, p. 835-845, 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
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15. | | GODOY, L. P.; CHUEIRE, L. M. de O.; BARCELLOS, F. G.; VASCONCELOS, A. T. R.; GONZAGA, L. de P.; NICOLÁS, M. F.; HUNGRIA, M. Panorama genômico da estirpe de Bradyrhizobium japonicum CPAC 15, recomendada para o uso em inoculantes comerciais para a cultura da soja. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 2005, Londrina. Resumos expandidos. Londrina: Embrapa Soja, 2005. p. 98-103. (Embrapa Soja. Documentos, 268).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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16. | | GODOY, L. P.; CHUEIRE, L. M. de O.; BARCELLOS, F. G.; VASCONCELOS, A. T. R.; GONZAGA, L. de P.; NICOLÁS, M. F; SOUZA, R. C.; HUNGRIA, M. Panorama genômico da estirpe de Bradyrhizobium japonicum CPAC 15, recomendada para o uso em inoculantes comerciais para a cultura da soja. In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 2., 2006, Londrina. Resumos expandidos. Londrina: Embrapa Soja, 2006. p. 156-161. (Embrapa Soja. Documentos, 276).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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17. | | GODOY, L. P.; CHUEIRE, L. M. de O.; BARCELLOS, F. G.; VASCONCELOS, A. T. R.; GONZAGA, L. de P.; NÍCOLAS, M. F.; SOUZA, R. C.; HUNGRIA, M. Panorama genômico da estirpe SEMIA 5079 (=CPAC 15) de Bradyrhizobium japonicum, recomendada para inoculantes comerciais na cultura da soja. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 27.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 11.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 9.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 6., 2006, Bonito, MS. A busca das raízes: anais. Dourados: Embrapa Agropecuária Oeste, 2006. 1 CD-ROM. (Embrapa Agropecuária Oeste. Documentos, 82).Biblioteca(s): Embrapa Soja. |
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18. | | PINTO, F. G. da S.; CHUEIRE, L. M. de O.; VASCONCELOS, A. T. R.; NICOLÁS, M. F.; GONZAGA, L.; ANDRE, E.; HUNGRIA, M. Panorama genômico de Rhizobium tropici estirpe PRF 81 (Semia 4080). In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 2005, Londrina. Resumos expandidos. Londrina: Embrapa Soja, 2005. p. 50-55. (Embrapa Soja. Documentos, 268).Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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20. | | BABUJIA, L. C.; SILVA, A. P.; NAKATANI, A. S.; CANTAO, M. E.; VASCONCELOS, A. T. R.; VISENTAINER, J. V.; HUNGRIA, M. Impact of long-term cropping of glyphosate-resistant transgenic soybean [Glycine max (L.) Merr.] on soil microbiome. Transgenic Research, Feb., p.1-6, 2016.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Soja; Embrapa Suínos e Aves. |
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